นอกจากนี้ ราชกิจจานุเบกษา เผยแพร่หลักเกณฑ์ วิธีการ และเงื่อนไขการตรวจสอบทรัพย์สินและชำระบัญชี การโอนหรือการจำหน่ายทรัพย์สินที่ยังคงเหลืออยู่ และการจัดการเกี่ยวกับบุคลากรของสถาบันบริหารจัดการธนาคารที่ดิน (องค์การมหาชน)

โดยมีสาระสำคัญในการจัดการทรัพย์สินและบุคลากรของสถาบันฯ ดังนี้

เรื่องเงินและทรัพย์สิน

ส่งมอบเอกสารและบัญชี : สถาบันฯ ต้องรวบรวมข้อมูลทรัพย์สิน หนี้สิน งบประมาณ และเอกสารทั้งหมดส่งมอบให้สำนักงานคณะกรรมการนโยบายที่ดินแห่งชาติ (สคทช.) ภายใน 30 วัน

ห้ามสร้างหนี้เพิ่ม : ห้ามสร้างหนี้หรือผูกพันทรัพย์สินใหม่ ทำได้เฉพาะเท่าที่จำเป็นต่อการปิดบัญชีเท่านั้น

การใช้เงินทุนสะสม : นำเงินสะสมมาใช้จ่ายเฉพาะเรื่องที่จำเป็น เช่น ค่าใช้จ่ายชำระบัญชี เงินชดเชยเลิกจ้าง และเงินทุนตั้งต้นสำหรับหน่วยบริการใหม่

เงินเหลือส่งคืนรัฐ : เมื่อเคลียร์บัญชีเสร็จสิ้นแล้ว เงินที่เหลือทั้งหมดต้องโอนส่งคืนเป็นรายได้แผ่นดิน ภายใน 30 วัน

เรื่องพนักงานและบุคลากร

ได้รับเงินชดเชยเลิกจ้าง : พนักงานและลูกจ้างที่ต้องออกจากงานเนื่องจากการยุบสถาบันฯ จะได้รับเงินค่าตอบแทนการเลิกจ้างตามระเบียบ

จ้างพนักงานเดิมช่วยปิดบัญชี : ในวาระแรก จะจ้างพนักงานเดิมของสถาบันฯ เข้ามาช่วยทำหน้าที่จัดการเอกสารและเคลียร์บัญชี

ผู้รับผิดชอบและระยะเวลาดำเนินการ

คณะกรรมการปิดบัญชี : แต่งตั้งคณะกรรมการ 5 คน เข้ามาตรวจสอบทรัพย์สินและปิดบัญชีให้เสร็จสิ้น ภายใน 1 ปี

การดูแลเกษตรกร : สัญญาหรือภารกิจที่ยังค้างอยู่กับเกษตรกร ให้ สคทช. เข้ามาดูแลชั่วคราว และหาหน่วยงานรัฐมารับช่วงต่อให้เสร็จ ภายใน 1 ปี

ทั้งนี้ สถาบันบริหารจัดการธนาคารที่ดิน (องค์การมหาชน) หรือ บจธ. ถูกจัดตั้งขึ้นตามพระราชกฤษฎีกาจัดตั้งสถาบันฯ พ.ศ. 2554 โดยมีเหตุผลสำคัญ ดังนี้

ปัญหาการขาดแคลนและเข้าไม่ถึงที่ดินทำกิน : เกิดจากปัญหาการขาดแคลนที่ดินทำกินและการที่เกษตรกรรายย่อยรวมถึงผู้ยากจนไม่สามารถเข้าถึงที่ดินได้ ซึ่งเป็นปัญหาสำคัญของประเทศที่มีมาอย่างยาวนาน

การกระจุกตัวและการเก็งกำไรที่ดิน : เกิดจากปัญหาการกระจุกตัวของการถือครองที่ดินและการเก็งกำไรในที่ดิน ทำให้มีที่ดินถูกทิ้งร้าง ไม่ทำประโยชน์ หรือใช้ประโยชน์ได้ไม่เต็มที่ จนสูญเสียพื้นที่ที่เหมาะสมสำหรับการทำเกษตรกรรม และส่งผลกระทบต่อการอนุรักษ์ทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อม

เจตนารมณ์ตามรัฐธรรมนูญ : รัฐธรรมนูญแห่งราชอาณาจักรไทยกำหนดให้รัฐต้องกระจายการถือครองที่ดินอย่างเป็นธรรม และดำเนินการให้เกษตรกรมีกรรมสิทธิ์หรือสิทธิในที่ดินเพื่อประกอบเกษตรกรรมอย่างทั่วถึง

ความจำเป็นในการมีหน่วยงานรับผิดชอบโดยตรง : เนื่องจากในขณะนั้นยังไม่มีองค์กรหรือสถาบันการเงินใดรับผิดชอบโดยตรงในการจัดให้มีการใช้ประโยชน์ในที่ดินอย่างเหมาะสม และสนับสนุนทางการเงินแก่การปฏิรูปที่ดินเพื่อเกษตรกรรม

การจัดตั้งในรูปองค์การมหาชน : เพื่อให้มีองค์กรที่สามารถดำเนินงานแก้ไขปัญหาเกี่ยวกับที่ดินได้อย่างเป็นอิสระ คล่องตัว และมีประสิทธิภาพ จึงได้จัดตั้ง บจธ. ขึ้นในรูปแบบองค์การมหาชน

การรับโอนภารกิจนำร่อง : ในช่วงเริ่มแรกได้มีการโอนบรรดาอำนาจ หน้าที่ กิจการ ทรัพย์สิน สิทธิ หนี้ และงบประมาณจาก สถาบันพัฒนาองค์กรชุมชน (องค์การมหาชน) เฉพาะในส่วนที่เกี่ยวกับ “โครงการนำร่องแก้ไขปัญหาที่ดินทำกินของเกษตรกรรายย่อยไทยเข้มแข็ง ภายใต้นโยบายกองทุนธนาคารที่ดิน” มาดำเนินงานต่อเนื่องภายใต้ บจธ.